Парк находится на территориях трех административных районов Республики Башкортостан (Мелеузовский, Бурзянский, Кугарчинский), площадь его составляет 82300 га. Удачное расположение на границе природных зон (лесной и степной), а также на границе биогеографических областей (европейской и сибирской) определяет повышенное биологическое разнообразие его экосистем. 90% территории занимают широколиственные леса и их мелколиственные производные. Одной из основных лесообразующих пород является липа, произрастают также осина, береза, дуб, иногда встречаются еловые и сосновые древостой.
По рекам Нугуш и Белая на небольших площадях распространены сосновые и реликтовые широколиственно-еловые леса, есть участки горных степей. Широко представлены луга, большей частью сформировавшиеся на месте сведенных широколиственных лесов.
Одной из приоритетных задач, выполняемых парком, является охрана флористического и фаунистического разнообразия.
На сегодняшний день выявленная флора сосудистых растений включает около 750 видов, 93 вида мохообразных, 52 вида лишайников, 107 видов грибов, 212 видов водорослей. Среди сосудистых растений 125 видов считаются в Предуралье и на Южном Урале редкими, 44 редких и исчезающих видов включены в Красную книгу Республики Башкортостан - это венерин башмачок крупноцветковый, глобулярия крапчатая, коцеечник крупноцветковый и другие, 15 видов занесены в Красную книгу Российской Федерации. Лобария легочная - вид лишайника, встречающийся на территории парка, занесен во все существующие Красные книги европейских стран. В результате вырубки широколиственных лесов в Европе его не осталось. В 2007 году по территории парка свои исследовательские работы проводили лихенологи. В результате предварительного определения коллекции лишайников было выявлено 114 видов лишайников (относящихся к 56 родам и 27 семействам), из них 17 видов ранее не отмечались для лихенофлоры Башкортостана.
С 2007 года начата работа по инвентаризацию почвенного покрова и изучение влияния рекреационных нагрузок на почву на территории баз отдыха и детских лагерей. Произведены отборы проб почв для определения влажности и плотности, других показателей.
Животный мир национального парка многообразен и интересен. Фауна характерна для лиственных и смешанных лесов Южного Урала. Типичными обитателями заповедных лесов являются куница, бурый медведь, волк, лось, косуля. В долине реки Белой выявлены 24 вида почвенных насекомых, 115 видов наземных насекомых, 165 видов донных беспозвоночных. По литературным и опросным данным, зарегистрировано: 56 видов млекопитающих, 7 - пресмыкающихся, 9 -амфибий, 32 - рыбы.
В национальном парке «Башкирия» отмечено 228 видов птиц, из них гнездящимися являются 142 вида. Около 40 редких и исчезающих видов птиц, 23 из них занесены в Красную книгу Российской Федерации, а 13 - даже гнездятся здесь. Это черный аист, скопа, степной лунь, змееяд, большой подорлик, могильник, беркут, орлан-белохвост, сапсан, серый сорокопут. Из редких птиц парка 7 видов (краснозобая казарка, белоглазый нырок, степной лунь, большой подорлик, могильник, беркут, орлан - белохвост и степная пустельга) включены в Красную книгу Международного союза охраны природы. Можно встретить в парке и редкие виды бабочек. Особо охраняются места обитания башкирской бортевой пчелы.
На территории национального парка расположены 3 памятника природы. Они удивительны в происхождении, интересны для ученых и просто красивы.
Карстовый мост «Куперля» - гидрогеологический памятник природы, учрежден в 1965 году ("куперля" дословно с башкирского языка - «с мостом»). Находится на территории парка, в 4-х километрах от бывшего хутора Савка. Природный мост перекинулся через каньонообразную долину реки Куперля, правого притока реки Нугуш. Мост двухпролетный, с одной колонной посередине. Высота над днищем долины Куперли составляет около 20 м, ширина -4 м, длина обоих пролетов - 35 м, длина висячей части - 10 м.
Куперлинский мост представляет собой остаток кровли древней пещеры, и образовался в ходе развития карстовых процессов. Речка Куперля, исчезая в подземном канале в 3-4 километрах от хутора Савка, стала течь под землей и разрабатывать пещеру в результате растворения и эрозии. В своем развитии пещера достигла такого момента, когда ее кровля стала обрушиваться под действием собственной тяжести и выветривания.
Урочище Кутук-Сумган - гидрогеологический памятник природы, учрежден в 1965 году («кутук» с башкирского языка - «колодец», «сумган» - «нырнул»). Кутук-Сумган расположен между реками Белой и Нугуш, в 20-25 километрах к востоку от п. Нугуш. Межгорная впадина ограничена с запада хребтом Яман - Тау, а с востока - хребтом Кибиз. С севера и юга котловина ограничена каньонообразными долинами рек Нугуша и Белой.
В рельефе карст представлен воронками, котловинами, колодцами, руинами, останцами, арками, мостами, тоннелями, пещерами, пропастями, провалами. Долины рек оказались с висячими устьями, а в профиле они представляют ступенчатое строение. В урочище выявлено и изучено 40 пещер. Часть из них имеет оледенение. Пещеры исключительно богаты натечными формами. Здесь имеются кальцитовые плотины, карманы и камеры, пещерный «жемчуг». Длиннейшая пещера Урала - пропасть Сумган с общей протяженностью ходов 9860 м, карстовой пропастью глубиной 111м. Это самая труднопроходимая пещера региона.
«Медвежья поляна» - ботанический памятник природы, учрежден в 1985 году специально для охраны лука-косого. Это древнее растение, имеющее на Южном Урале изолированный реликтовый ареал. Луковичный многолетник высотой до 100 см. По внешнему виду очень похож на огородный чеснок. Ценные пищевые качества стали основной причиной редкости в природе: его попросту во многих местах съели. Ученые рекомендуют лук-косой ввести в культуру (неприхотлив, дает обильный самосев), это способствовало бы сохранению вида в природе.
Также на территории национального парка «Башкирия» имеются природные объекты, предлагаемые для включения в список геологических памятников природы. Это археологические пещеры, привлекательные урочища, интересные геологические разрезы:
пещера Касабай - пол, а местами и стены покрыты многолетним льдом;
пещера Зигзаг (Казанка) - внутри пещеры протекает подземная река, вероятно, продолжение р. Кутук;
пещера Байслан-Таш - исследователями и археологами были сделаны интересные находки, подтверждающие ее обитаемость в эпоху палеолита до раннего железного века (более 30 тыс. лет);
пещера Муйнак-Таш (Театральная) - на стенах и потолке встречаются кальцитовые натеки;
урочище «Пятилистник» - речной каньон с пятью крупными излучинами, скалистые берега возвышаются над рекой на 100 м и более;
урочище «Муйнак-Таш» - красивейший природный объект со скалой-останцем, пещерой Театральной, карстовой формой долины ручья Зириклы;
геологические разрезы - интереснейшим и прекраснейшим являются разрезы от нижнего девона до верхнего карбона, расположенные на ручье Акаваз, р. Иргизлы, на берегу реки Белой между устьями притоков Буйляу и Саргайлы.
На территории национального парка «Башкирия» интересными и притягательными для отдыха являются Нугушское и Юмагузинское водохранилища, а также горные реки Белая, Нугуш, многочисленные ручьи с прозрачной чистой водой. На живописных берегах водохранилищ расположены многочисленные туристические базы и дома отдыха. Самая прекрасная река Башкортостана - это река Белая (Агидель). Такое название она получила за светлый, белосовато-серебристый цвет воды. В пределах территории парка ее протяженность составляет около 110 километров, из них 57 приходится на Юмагузинское водохранилище. Река Нугуш (с тюркского языка как «светлая, чистая») берет свое начало в Белорецком районе и протекает в северной части территории парка, извиваясь среди гор, наполняя «чашу» Нугушского водохранилища. Основными притоками являются речки Урюк, Тор, Бретяк, Малый Нугуш, Кужа. Как гласит легенда, Нугуш - это имя батыра, который вместе с Урал-батыром и другими батырами освобождали наши земли от злых чудовищ.
В парке имеется ряд небольших озер искусственного происхождения - Теплое, Холодное и Иштугановские карьеры. Исчезающие речки Сумган, Кутук, Юрмаш, Савка в течение многих тысячелетий пробивали себе путь, образуя пещеры, карстовые туннели, мосты, останцы карстовой денудации, воронки, карстовые озера.
Главной достопримечательностью национального парка можно назвать Нугушское водохранилище, которое стало заполняться в результате перекрытия реки Нугуш 14 сентября 1965 года, задолго до образования парка. На месте нынешнего поселка Нугуш стоял лес, шумели поля ржи и пшеницы, по степи бродил скот близлежащих деревень Кинзябаево, Привольного, Та-шево. В связи с большим ростом нефтехимических и других заводов в городах Салават, Ишимбай и Стерлитамак сток рек Белой и Нугуш в дальнейшем не смог бы обеспечить потребности производства и населения в воде. Поэтому было решено построить водохранилище на реке Нугуш.
Объем водохранилища составляет 400 млн. куб. м воды, площадь зеркала - 25 кв. км, максимальная глубина - до 30 м. Это не только излюбленное место отдыха людей, но и производственный объект, предназначенный для хозяйственно-питьевого и технического водоснабжения промышленных районов городов Салават, Ишимбай, Стерлитамак. Гидроэлектростанция построена на реке Нугуш, которая дала свое имя и поселку, и «морю».
Другая достопримечательность, которой славится национальный парк, это Юмагузинское водохранилище, нередко называемое «Башкирским Байкалом». Его акватория составляет 57 кв. км. Водохранилище имеет экономическое и социальное значение в развитии Башкортостана. Многие населенные пункты и хозяйственные объекты защищены от затопления в паводковый период. Обеспечено бесперебойное снабжение водой городов Стерлитамак, Салават, Кумерт Мелеуз и Ишимбай.
ПАРК ПРИВЛЕКАЕТ ЛЮДЕЙ
На Земле много красивых и интересных мест, но есть уголки природы, которые как будто специально созданы для души. Сказочный мир пещер, горные ручьи с хрустально чистой водой, бьющей из-под земли, величественные горы, изумрудная зеркальная гладь водохранилищ, умиротворяющее течение рек - все это завораживает, изумляет и навсегда находит место в самых потаенных уголках сердца.
Отличительная черта национальных парков от заповедников заключается в том, что здесь разрешен доступ туристов при условии соблюдения природоохранного режима. Для этих целей в природных парках выделяются специально отведенные рекреационные зоны, разрешается строительство объектов для отдыха. На территории национального парка «Башкирия» расположено 25 баз отдыха и детских оздоровительных лагерей, сотрудники обустраивают привалочные места для туристов. Организуются конные, водно-пешие, водные экскурсии, туристические походы. Имеются также экологические тропы в окрестностях п. Нугуш, Нугушского и Юмагузинского водохранилищ.
Территория национального парка - это исключительное место для развития бортничества, с сохранившимися бортями конца XIX и начала XX века, со старовозрастными деревьями сосны, подходящими для изготовления новых бортей и колод. На сегодняшний день пасека национального парка «Башкирия» составляет около десятка единиц пчелосемей.
Каждый год сотрудниками НП «Башкирия» выпускаются познавательные брошюры и буклеты о национальном парке, его растительности и животном мире, птицах и грибах, таинственных пещерах и голубых водоемах, календари, а также памятки отдыхающим и туристам. В 2007 году вышли в свет первое научно-популярное издание «Национальный парк «Башкирия» и книга - сборник научных статей «Экологические аспекты сохранение логического разнообразия Национального парка «Башкирия» и других территорий Южного Урала», посвященные юбилею парка. На базе парка проходят научно-практические семинары, конференции, совещания.
По материалам ТАБИГАТ

